Satoko Kusagakure, uma ninja que abandonou sua vila com seus companheiros, acaba vivendo com Konoha, uma estudante do ensino médio que trabalha como assassina na cidade.
Satoko possui a habilidade de transformar objetos usando ninjutsu, o que chama a atenção de Konoha. As duas fazem um acordo: Konoha oferece um lugar para Satoko morar em troca da ajuda dela na limpeza após seus assassinatos. Enquanto enfrentam assassinos enviados pela antiga vila de Satoko, também se deliciam com refeições compradas com o dinheiro que ganham matando.
Em meio ao caos dessa convivência nada convencional, a história acompanha suas vidas emocionantes, perigosas e surpreendentemente divertidas.

A Ninja and an Assassin Under One Roof , NinKoro , A Ninja and an Assassin Living Together , Ninja to Koroshiya no Futarigurashi , 忍者と殺し屋のふたりぐらし